1998年11月，WIPO出臺了《專利申請中核苷酸和氨基酸序列表的表述標準》(WIPO ST.25標準)，為統(tǒng)一全球的標準并提高電子形式的驗證匹配和提供更精確的生物序列信息，WIPO標準委員會制定了WIPO ST.26標準，并要求于2022年1月1日起，WIPO所有成員國在國際、國家或者地區(qū)層面上提交的生物序列文件，都要符合WIPO ST.26標準。與WIPO ST.26標準同步發(fā)布的，還有WIPO提供的名為“WIPO Sequence”的桌面工具，該工具的作用是編制符合WIPO ST.26標準的氨基酸和核苷酸序列表。我國國知局也宣布從2022年7月1日起，向國知局提交的國家專利申請和PCT國際申請中包含有序列表的，該序列表電子文件應(yīng)符合WIPO ST.26標準要求，也就是說WIPO Sequence已經(jīng)成為生物領(lǐng)域?qū)＠韼煴夭豢缮俚墓ぞ摺?/p>
但是WIPO Sequence面世時間較短，用戶對其功能的發(fā)掘程度較少，官方用戶手冊中的記錄也比較簡單，因此，大部分申請人只了解簡單的創(chuàng)建方法，在面對一些需要進行批量處理的操作時不知道如何快捷處理。例如，生物醫(yī)藥專利申請中，有時需要處理上百條序列，面對密密麻麻的序列表，代理人常常痛苦不已，如果在WIPO SEQUENCE中使用常用的單獨創(chuàng)建方式，一個一個地去創(chuàng)建序列，處理上百條序列時不僅耗費時間，還易出錯。
那么，有什么批量處理的方法可以讓我們的代理工作事半功倍呢?
筆者在查閱了官方用戶手冊(https://www.wipo.int/export/sites/www/standards/en/sequence/wipo-sequence-manual.pdf)及多次嘗試后，總結(jié)出了一個批量導(dǎo)入序列的方法。
第一步，先按照WIPO SEQUENCE官方的ST.25格式(圖1)對序列表進行修改：
圖1(來源于用戶手冊)
上面的官方說明，簡單翻譯一下就是要按<序列名稱; 序列類型; 生物體>的順序?qū)γ總€序列進行注釋，這里的序列名稱、序列類型、生物體參照我們單獨創(chuàng)建序列時WIPO SEQUENCE官方提供的選項進行撰寫即可。例如，序列類型有DNA、RNA和AA，然后在注釋下面另起一行，輸入序列(友情提示：按照ST.26的要求，RNA里的u需要替換為t)。對所有的序列都按上述格式進行修改后，將文本保存為txt格式就可以進行下一步操作。按照一般軟件的讀取習(xí)慣，這里建議所有的標點符號都用英文版本，分號后加上空格。筆者沒有嘗試過用中文標點符號，不確定是否會影響上傳。
第二步，在WIPO SEQUENCE中創(chuàng)建項目，并依據(jù)個人需求進行信息填寫，這一步相信大家都會做，網(wǎng)上也有不少教程就不在此進行贅述。
第三步，進入我們已經(jīng)建好的項目中，選擇導(dǎo)入序列后上傳文件即可。
下面簡單舉例說明：
首先，將序列表修改為如下格式后，保存為txt格式：
<001; RNA; synthetic construct>
acagtgccatgagcatga
<002; DNA; synthetic construct>
accgctggcctctgtgca
<005; AA; synthetic construct>
NAYVGFSANVRSPFEYPQYYLAECNLEGFTLGGPPPEIAVTIPMIIIFFCYGQLVFTVCKTVASTLYTTVQKSMLAAWEKVIAAFLICCWVPVYAQASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFVVTCKSIYNPVMAACV
然后，在創(chuàng)建好的項目中選擇導(dǎo)入序列，隨后上傳文件(圖2～3)，是否勾選“輸入待導(dǎo)入的序列”并不會影響結(jié)果，不勾選時只是不會顯示序列號等內(nèi)容(圖2～4)。導(dǎo)入序列之后，就可以按通常做法進行編輯、打印、生成序列表等常規(guī)操作，最終生成的序列表如圖5.符合國知局要求。
圖2
圖3
圖4
圖5
經(jīng)過對如何批量處理序列表這一問題的探索，不難看出，WIPO官方提供的軟件功能較為齊全，用戶界面也簡單明了，但用戶對其發(fā)掘程度較淺，還有很多功能待開發(fā)，期待有更多后來人把官方提供的各種用戶手冊最大程度地利用起來，發(fā)掘更多的快捷操作，助力專利申請。
注：*本文作者來自于駱順耀團隊
(原標題：WIPO Sequence 批量導(dǎo)入序列的方法)
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